Insuficienta ovariana apare de cele mai multe ori din cauza disgeneziei gonadice in care celulele germinative lipsesc si ovarul este inlocuit de o banda fibroasa.
In functie de cauza, aceasta afectiunea poate aparea inca din perioada adolescentei. Insuficienta ovariana prematura este numita si menopauza prematura, desi cele doua afectiuni nu sunt identice.